À cause d'une mystérieuse trouvaille Mirai Kotobuki, une élève qui ne prend pas sa scolarité au sérieux et dont le rêve est de se marier et d'avoir des enfants, voit son monde s'écrouler quand un homme excentrique débarque dans sa classe. Noah Minami Umberbach, qui est d'abord pris pour un terroriste, est en fait un archéologue ! Venu récupérer le fossile qu'a trouvé Mirai, cette dernière va se retrouver embarquée contre son gré dans une aventure qui risque de lui faire changer sa perception de l'Histoire…